尖銳濕疣早期癥狀多為淡紅色或皮色丘疹狀，漸次增大增多，融合成乳頭狀、菜花狀或雞冠狀增生物，根部可有蒂，疣體表面呈白色，污灰色或粉紅色，可有癢感、灼痛和惡臭。
潛伏期3周到8個月，平均3個月，多見于性活躍的青、中年男女，發病高峰年齡為20-25歲，病程平均在3-5個月的男女患者，在性接觸后不久即發病，而病程平均12個月的男性患者，其性接觸者可不發病。多數患者一般無癥狀。損害大小及形狀不等。可僅為數個，亦可為多數針頭樣大的損害：在陰肛部可長成大的腫瘤樣物，有壓迫感;有惡臭味;有時小的濕疣可出現陰部痛癢不適，病人可出現尿血和排尿困難;直腸內可發生疼痛、便血，而直腸內大的濕疣則可引起里急后重感。
男性患者好發于包皮系帶、冠狀溝、包皮、尿道、陰莖、肛門周圍和陰囊。病初為淡紅或污紅色粟狀大小贅生物，性質柔軟，頂端稍尖，逐漸長大或增多。可發展成乳頭狀或囊狀，基底稍寬或有帶，表面有顆粒。在肛門部常增大，狀如菜花，表面濕潤或有出血，在顆粒間常積存有膿液，散發惡臭氣味，搔抓后可繼發感染。位于濕度較低干燥部位的生殖器疣，損害常小而呈扁平疣狀。位于濕熱濕潤部位的疣常表現為絲狀或乳頭瘤狀，易融合成大的團塊。有嚴重肝病的患者可增大，妊娠可使復發或生長加快。