各種結膜炎，是由于微生物感染引起，傳播方式主要是接觸傳染，所以加強預防工作，切斷傳播途徑，控制并消滅傳染源是很重要的，在廣泛暴發流行的情況下，更要加強對患者的管理，隔離和治療，強調個人衛生，和良好的，習慣培養，加強對公用事業如公共浴池，游泳池，理發館，賓館酒店，公務車輛等，的衛生監督管理，銀行做好回籠貨幣，消毒工作，對于結膜炎的預防是非常重要。
結膜炎的治療，在多數情況下，采用局部藥物治療，即可達到**的目的，某些特殊細菌，病毒，衣原體感染，需要配合全身用藥，局部用藥物有滴眼液，眼膏，和沖沖洗溶液。特殊情況下也可配合結膜下注射給藥。
滴眼液有磺胺類藥和抗生素，抗病毒藥以及皮質類固醇藥物，藥物的選用用對微生物種類很強，抗菌譜廣，都要我來參與，因為臨床工作中很少做細菌學的檢查，撥付結膜炎為急性發病，實驗室病原體分離鑒定，藥物敏感試驗等工作，不能及時得到結論，所以應避免各種結膜炎的臨床特點，作圖病人判斷，及時正確的選擇，兩種到3種藥物配合使用，比較重要，皮質類固醇藥物，對變態反應性結膜炎反應較好，配合抗菌藥物可減輕細菌性結膜炎的浸潤和滲出。病毒性結膜炎治療中，這類藥物也可以抗病毒藥，配合使用，但應該密切注意角膜并發癥的發展。
滴眼液的優點是作用較快，保留時間很短，眼膏劑，做工較慢，但可以較長時間保持在結膜囊，藥物濃度，較高，同時可以避免早晨分泌物使上睫毛和眼睛粘合在一起，缺點是，眼膏劑涂抹后，多附著于角膜表面視物模糊，所以適宜在晚間使用。