尖銳濕疣的病程不定，常持續多年，經久不愈，少數較小的疣體可能在數月內自行消退，但仍會復發。尖銳濕疣復發的原因與下列因素有關。
(1)激光、電灼、冷凍、手術及局部點涂藥物等治方法只能去除臨床肉眼所見的疣體，而肉眼能見的疣僅是所有HPV感染中的一小部分，因此不能去除亞臨床感染及治療后殘留的病毒，所以復發率高。
(2)尖銳濕疣患者的性伴侶沒有得到有效的檢查或治療，另一方仍是亞臨床感染或病毒攜帶者，導致再次感染。
(3)部分患者除尖銳濕疣外，還有其他引起細胞免疫功能異常的性病或其他系統性疾病，如腎移植術后長期口服免疫遏制劑的病人、艾滋病病人尖銳濕疣的復發率較高。
(4)雌激素水平較高的病人易復發。妊娠期感染HPV后生長速度快且疣體大，與雌激素受體在妊娠期的組織中的數目高于非妊娠期相關。
(5)少數患者生活習慣不良，在治療的同時，往往生活不規律、熬夜酗酒、不注意鍛煉身體等，影響自身的免疫功能，增加尖銳濕疣復發的可能性。
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1、痛苦小，疣體自行干枯、脫落;