腎結石結石致泌尿系管腔內堵塞可造成梗阻部位以上的積水。結石性梗阻常為不完全性梗阻，有的結石表面有小溝，尿液可沿小溝通過;有時結石雖較大，甚至呈鑄狀結石，但尿仍能沿結石周圍流出，也可能在長時間內不引起積水，腎盂壁纖維組織增生變厚時，則擴張表現不明顯。
1.泌尿系梗阻
腎結石發生梗阻由于發病緩急不同，其臨床表現有很大差異。盡管最終均可引起腎盂積水，但臨床不一定以腎盂積水為主要表現。腎盂積水有時無任何臨床癥狀，部分病例直到腎盂積水達嚴重程度，腹部出現腫物和腎功能不全，甚至無尿時才被發現。
2.局部損傷
小而活動度大的結石，對局部組織的損傷很輕，大而固定的鹿角狀結石可使腎盞、腎盂上皮細胞脫落，出現潰瘍、纖維組織增生、中性粒細胞和淋巴細胞浸潤，以致纖維化。移行上皮細胞長期受結石刺激后，可發生鱗狀上皮細胞化生、甚至可引起鱗狀上皮細胞癌，因此應做尿脫落細胞學檢查。盡管尿脫落細胞異常不一定能使之確診，但從中可獲得尿路上皮細胞發生異常改變的提示。對于長期存在的腎盂或膀胱結石都要想到上皮細胞癌變的可能，手術時應取活體組織送快速冰凍切片檢查。
3.感染
有無感染對腎結石的治療和防治有重要意義。尿路感染病人臨床表現為發熱、腰痛、尿中出現膿細胞。尿培養有細菌時，應同時做藥敏試驗。
結石合并感染時，可加速結石的增長和腎實質的損害。在結石排出或取出前，這種感染很難**，可發生腎盂腎炎、腎積膿、腎周圍炎、嚴重者甚至可發展為腎周圍膿腫;與腹膜粘連后，可穿破入腸管。顯微鏡下可見腎間質炎癥，細胞浸潤和纖維化，腎小管內有中性粒細胞和上皮細胞，后期出現腎小管萎縮和腎小球硬化。