臨床上診斷尖銳濕疣時要慎重，因為男性的陰莖珍珠狀丘疹病和女性的假性濕疣容易與尖銳濕疣混淆，其主要區別如下。

　　疾病的病因不同：珍珠狀陰莖丘疹病和女性假性濕疣是一種良性皮膚發育不全的狀態，生理性變異，在正常人群中有10%的人有此病。據調查，在處女和沒有過性接觸的男性中，本病的患病率也很高。本病不是由性接觸而感染的，不屬于性傳播疾病范圍。尖銳濕疣，是由于人乳頭瘤病毒感染引起的慢性增生性疾病，可通過性接觸而感染的，是性傳播疾病中的一種。

　　臨床表現不同：男性珍珠狀陰莖丘疹病的特點，是在沿冠狀溝龜頭緣處分布的小米粒大小的丘疹。女性假性濕疣是在小陰唇內側呈對稱性的、條索形的指狀丘疹，分布稠密，也可呈魚子狀。本病可無任何不適感，不需治療，無傳染性。尖銳濕疣是在男女的外生殖器處散在的，呈菜花狀皮膚疣狀物，分布無規律性，無明顯瘙癢感，有異味。陰道內生長的尖銳濕疣可自行出血，有自身傳染性，未經治療本病可繼續發展，其數目越來越多，疣體逐漸增大堵塞陰道口。

　　女陰假性濕疣的表現與尖銳濕疣的癥狀不同，假性濕疣為多發生于兩側小陰唇內側，其次為陰道前庭、陰道口，直徑1～2毫米，為淡紅色或黏膜色的丘疹，大都對稱分布，形狀比較規則，外觀絨毛狀或魚子狀。有時可見息肉狀、指狀突起，觸之有顆粒樣感，但均表面光滑、無角化。病理改變與尖銳濕疣也不一樣，醋酸白試驗亦陰性。好發于年輕女性，大都有不同程度的瘙癢，常與過度洗浴及摩擦有關，病程呈良性經過，減少摩擦可自然消失。也有人認為和念珠菌感染、滴蟲感染、慢性炎癥有關。

　　尖銳濕疣的診斷要點如下：1、典型病例可見外陰、陰道、子宮頸、會陰及肛門部位的尖銳濕疣，肉眼即可做出診斷。但確診需取病變組織做病理學檢查。2、5%醋酸試驗：于病變可疑部位上涂以5%醋酸，病變部位變白為陽性反應。3、細胞學檢查：取陰道、子宮頸的脫落細胞，或從病變部位刮取細胞，固定后用巴氏染色。鏡檢胞漿呈橙黃色，細胞核呈核異質及多核，細胞角化不全或呈空泡細胞。4、組織病理檢查：表皮疣狀或乳頭增生，角化不全，棘層不同程度增生肥厚，基底細胞增生，基質有炎癥細胞浸潤。5、陰道鏡檢查：將病灶放大10～20倍，可更容易發現病變部位。6、免疫組織化學檢查：檢測HPV抗原存在,其陽性率達50%～60%。

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